- تركز جامعة الامام جعفر الصادق (عليه السلام) على التميز باعلى مستويات الجودة والمهنية من خلال تطبيق معايير الاعتماد المؤسسي والبرامجي في الجامعة وتشكيلاتها.
- الارتقاء في المستوى المعرفي في الجامعة الى المستويات العالمية وتشجيع البحث العلمي في مجالاته كافة.
- استحداث برامج اكاديمية في الجامعة وفق المتطلبات الأكاديمية، والحاجات المجتمعية وذات الجودة العالمية.
- توفير البنى التحتية المتطورة للجامعة لتقديم بيئة تعليمية مناسبة لتمكين المدرسين والطلبة والباحثين فيها من تقديم افضل المستويات العلمية على مستوى البحث والمعرفة.
- تحسين التعليم والتميز في التدريس في البرامج الاكاديمية كافة وتشجيع اقبال الطلبة المتميزين للجامعة.
- تلبية حاجات المجتمع الاقتصادية والاجتماعية من خلال اجراء البحوث التطبيقية والتجارب العلمية.
- تشجع الجامعة على الابداع والابتكار لتحقيق حالة التمييز الاكاديمي .
- تعزز الجامعة الانفتاح والتنوع والنزاهة والحرية الاكاديمية في البحث والابتكار.
- اقامة علاقات تبادلية مع المؤسسات العلمية على المستوى الوطني والدولي بهدف الحصول على المعرفة والخبرة
- الادارة الفعالة والاستعمال الامثل لمرافق وموارد الجامعة وتطويرها وفق المعايير المقررة
- نشر ثقافة الجودة والوعي باهمية برامج التقويم بين كافة العاملين بالجامعة
- دعم مبدأ المشاركة المجتمعية لمؤوسسات المجتمع المدني والجمعيات المهتمة بالتعليم للمشاركة في رفد ودعم المؤسسات التعليمية
- دعم المؤسسات الخيرية ومنظمات المجتمع المدني، ذات الأهداف المشتركة مع الجامعة.
- المساهمة في إقامة مشاريع البر، وبناء المستشفيات والمراكز الصحية، ورعاية الأيتام، وعوائل الشهداء، وطلبة العلوم الدينية من العراق وخارجه.